生物安全柜中安全处理样本的实验操作过程中需要注意以下几点：
首先，实验室人员必须穿戴以下防护设备：口罩、眼罩、面罩、手套、鞋套、隔离服或防护服、呼吸器等，在离开实验室前应将其取下，为避免防护设备造成的环境污染。
其次，因为实验室生物污染的重要来源是产生气溶胶，实验室可以通过使用含有荧光素的假样本来检测气溶胶的产生路径以评估其传播水平。
再者，在使用注射器和皮下注射针头的时候，只能从隔膜塞住的试管中取出液体进行接种。严禁将皮下注射针头从注射器中取出或重新盖上盖子，以免造成意外的自我接种。
接着，实验室工作人员需要轻轻按压移液器应，并利用吸头抵住离心管或试管内壁，缓慢进行移液操作，进行样本处理。如若出现样本外溢，都需要马上使用消毒剂进行彻底清洁。
最后，实验结束后，所有工作台区域，实验室设备，如：移液器、试管架都必须进行严格的消毒，以确保实验及实验室安全。
